MolConverter

Input Ports

Input table that contains structure in Structure(Mrv, Sdf, Smiles, etc.) format.

Output Ports

Output table that contains converted structure in Structure(Mrv, Sdf, Smiles, etc.) format.

Popular Predecessors

• Molecule Type Cast9 %
• SDF Reader4 %
• Value Counter3 %
• MarvinSketch2 %
• MolConverter2 %
• Show all 352 recommendations

Popular Successors

• SDF Writer6 %
• Column Filter2 %
• Joiner2 %
• Validation and Normalisation2 %
• Structure Converter2 %
• Column Appender1 %
• MolConverter1 %
• XLS Writer1 %
• RDKit From Molecule1 %
• Molecule Type Cast1 %
• CIR1 %
• RDKit Molecule Substructure Filter1 %
• Row Filter (deprecated)< 1 %
• RDKit Canon SMILES< 1 %
• Nominal Value Row Splitter< 1 %
• Column Rename< 1 %
• CSV Writer< 1 %
• Feature Remover< 1 %
• Partitioning< 1 %
• PDB Saver< 1 %
• Table Writer< 1 %
• Duplicate Row Filter< 1 %
• Rule-based Row Splitter< 1 %
• CmdwInput< 1 %
• Excel Writer< 1 %
• Date&Time to String< 1 %
• RDKit Substructure Counter< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Concatenate< 1 %
• Cell Splitter< 1 %
• Call Workflow (Table Based)< 1 %
• InChi< 1 %
• MoleculeTransform< 1 %
• Cell Splitter< 1 %
• Reference Row Filter< 1 %
• String Manipulation< 1 %
• PaDEL-Descriptor< 1 %
• Data to Report< 1 %
• Elemental Analysis< 1 %
• 3D D-Similarity< 1 %
• PMI Calculation< 1 %
• Principal Moment of Intertia (PMI)-Derived Properties< 1 %
• Structure Checker< 1 %
• String to Molecule< 1 %
• Try (Data Ports)< 1 %
• Parameterized Database Query< 1 %
• Component Output< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Standardize< 1 %
• Molecule to CDK< 1 %
• Hydrogen Manipulator< 1 %
• Tautomer Generator< 1 %
• Indigo Fingerprint< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Java Snippet< 1 %
• String Replacer< 1 %
• Rule Engine< 1 %
• SDF Writer< 1 %
• MoSS< 1 %
• Excel Writer (XLS)< 1 %
• Molecular Properties< 1 %
• RDKit Kekulizer< 1 %
• RDKit Salt Stripper< 1 %
• RDKit Structure Normalizer< 1 %
• RDKit Two Component Reaction< 1 %
• Substructure Match Counter< 1 %
• Speedy SMILES Remove Multicomponent molecules Splitter< 1 %
• SMARTSViewer< 1 %
• MarvinView< 1 %
• Table Row to Variable Loop Start< 1 %
• Column Comparator< 1 %
• Column Resorter< 1 %
• Constant Value Column< 1 %
• HiLite Row Splitter< 1 %
• GroupBy< 1 %
• Pivot< 1 %
• Parallel Chunk Start< 1 %
• Math Formula< 1 %
• 2D Coordinates< 1 %
• Fingerprints< 1 %
• RDKit Diversity Picker< 1 %
• RDKit One Component Reaction< 1 %
• Filter Duplicates< 1 %
• Chemspace Search< 1 %
• pyflare< 1 %
• Reaxys Reactions< 1 %
• Reaction Splitter< 1 %
• Speedy SMILES Strip Stereochemistry< 1 %
• MolSearch< 1 %
• Similarity Viewer< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• Group Loop Start< 1 %
• Missing Value< 1 %
• Value Counter< 1 %
• Renderer to Image< 1 %
• Molfile Writer< 1 %
• Column Expressions (legacy)< 1 %
• OpenBabel< 1 %
• Java Snippet (simple)< 1 %
• Python Script (legacy)< 1 %
• Python Script< 1 %
• SMARTCyp 2.4.2< 1 %
• Element Filter< 1 %
• SMARTS Query< 1 %
• RDKit Add Conformers< 1 %
• RDKit Fingerprint< 1 %
• RDKit Substructure Filter< 1 %
• Generate 3D Coordinates< 1 %
• CIR< 1 %
• Docking (FlexX)< 1 %
• Write MDB< 1 %
• Canonical SMILES< 1 %
• Component Combiner< 1 %
• Dearomatizer< 1 %
• Hydrogen Adder< 1 %
• R-Group Decomposer< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Substructure Matcher< 1 %
• Valence Checker< 1 %
• Knime To SDF Port< 1 %
• ICon< 1 %
• PDB Writer< 1 %
• SDF Writer< 1 %
• Molecule-to-MAE< 1 %
• Speedy SMILES Charge Count< 1 %
• Speedy SMILES Convert to Scaffold< 1 %
• PDB Property Extractor< 1 %
• FRP< 1 %
• Advanced MolConverter< 1 %
• Chemical Fingerprint< 1 %
• Chemical Terms< 1 %
• logD< 1 %
• Major Microspecies< 1 %
• MCS< 1 %
• MolExporter< 1 %
• pKa< 1 %
• Tautomers< 1 %
• DbModelEval< 1 %
• Reportcard< 1 %
• Ligands and Proteins Viewer< 1 %
• ChemSpider (deprecated)< 1 %
• Table Column to Variable< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• CSV Writer< 1 %
• Table Writer< 1 %
• Chunk Loop Start< 1 %
• Column Auto Type Cast< 1 %
• Number To String< 1 %
• Column Renamer< 1 %
• Row Splitter (deprecated)< 1 %
• Reference Row Splitter< 1 %
• Joiner< 1 %
• RowID< 1 %
• Row Sampling< 1 %
• Sorter< 1 %
• Rule-based Row Filter< 1 %
• Create Temp Dir (legacy)< 1 %
• Interactive Table (legacy)< 1 %
• SDF Stripper< 1 %
• Mol2 Writer< 1 %
• Smiles Directory Writer< 1 %
• Distance Matrix Calculate< 1 %
• Similarity Search< 1 %
• External Tool (Labs)< 1 %
• Table View (JavaScript)< 1 %
• Inchi< 1 %
• Converter< 1 %
• Connectivity< 1 %
• 3D Coordinates< 1 %
• OPSIN< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• 3D Viewer< 1 %
• RDKit Generate Coords< 1 %
• RDKit Add Hs< 1 %
• RDKit Chemical Transformation< 1 %
• RDKit Descriptor Calculation< 1 %
• RDKit Functional Group Filter< 1 %
• RDKit Molecule Extractor< 1 %
• RDKit Find Murcko Scaffolds< 1 %
• RDKit Open 3D Alignment< 1 %
• RDKit Optimize Geometry< 1 %
• RDKit To InChI< 1 %
• RDKit To Molecule< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition< 1 %
• FTrees Query Generator< 1 %
• Wash< 1 %
• Chemspace Search< 1 %
• Reaxys Substances< 1 %
• Isomer Enumerator< 1 %
• Molecule to Indigo (deprecated)< 1 %
• CSV Writer< 1 %
• Stereoizer< 1 %
• Speedy SMILES Organic Subset Molecules Filter< 1 %
• logP< 1 %
• Catch Errors (Data Ports)< 1 %
• ImgPlus to PNG Images< 1 %
• Python Script (1⇒1)< 1 %
• CIR< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• RDKit Interactive Table< 1 %
• RDKit From IUPAC< 1 %
• RDKit Molecule Catalog Filter< 1 %
• RDKit Count-Based Fingerprint< 1 %
• VEGASMILES< 1 %
• SeeSAR Project Generator< 1 %
• Wash< 1 %
• ReaxysLookup< 1 %
• Component Separator< 1 %
• Highlighter< 1 %
• Hydrogen Remover< 1 %
• Generate 2D Coordinates< 1 %
• Murcko Scaffold< 1 %
• Molecule 3D Viewer< 1 %
• AutoQSAR Build Model< 1 %
• Set Molecule Title< 1 %
• Speedy SMILES Explicit Double Bond Geometry Filter< 1 %
• Speedy SMILES Remove f-block Metal-containing Molecules Filter< 1 %
• Speedy SMILES Clean Bonds< 1 %
• Speedy SMILES De-salt< 1 %
• Speedy SMILES Enumerate Stereoisomers< 1 %
• MMP Molecule Fragment (RDKit)< 1 %
• MolSimilarity< 1 %
• PubChem Search< 1 %
• Ligands Viewer< 1 %
• Reaction Vector Structure Generator< 1 %
• De Novo Structure Generator< 1 %
• Chemical File Writer< 1 %
• Plane of Best Fit Calculator< 1 %
• Breakpoint< 1 %
• Create File Name (legacy)< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• Loop End< 1 %
• Create Bit Vector< 1 %
• Cell Replacer< 1 %
• Column to Grid< 1 %
• Extract Missing Value Cause< 1 %
• Set Operator< 1 %
• Ungroup< 1 %
• Save Workflow< 1 %
• SDF Extractor< 1 %
• External Tool< 1 %
• Rule Viewer (local) (Legacy)< 1 %
• Excel Sheet Appender (XLS)< 1 %
• Java Snippet Row Splitter< 1 %
• Multi Feature Inserter< 1 %
• R Source (Workspace)< 1 %
• Presto Request< 1 %
• RDKit From InChI< 1 %
• RDKit Remove Hs< 1 %
• RDKit SMILES Headers< 1 %
• ActMolecule from Molecule< 1 %
• Similarity Calculator (FTrees)< 1 %
• Reaction Space Generator< 1 %
• Assess Affinity with Hyde in SeeSAR< 1 %
• Retrosynthetic Synthesizability< 1 %
• Write ASCII< 1 %
• Predictor< 1 %
• Combinatorial Reaction Enumeration (beta)< 1 %
• Molecule Transformation (beta)< 1 %
• AutoDock Vina< 1 %
• MolConfGen< 1 %
• R-Group Decomposer Extended< 1 %
• Speedy SMILES Chiral Centre Count< 1 %
• Speedy SMILES Element Count (C, N, O)< 1 %
• MMP Molecule Multi-cut Fragment (RDKit)< 1 %
• Reference Fragments to MMPs< 1 %
• Uniquify IDs< 1 %
• R Snippet< 1 %
• BARD Search by Structure< 1 %
• Bi Reactor (By Input)< 1 %
• Get Atom Selection< 1 %
• Split Into Fragments< 1 %
• Chemical Search< 1 %
• Proteins Viewer< 1 %
• SyGMa Metabolites< 1 %
• Structures PDB Mapper< 1 %
• Reaction Vector Generator< 1 %
• Table to String< 1 %
• XLS Coloured Writer< 1 %
• Table to Image< 1 %
• List Files< 1 %
• Column List Loop Start< 1 %
• Column Aggregator< 1 %
• Column Splitter< 1 %
• Statistics< 1 %
• Parallel Chunk End< 1 %
• Counter Generation< 1 %
• Ligands and Proteins Viewer< 1 %
• Math Formula (Multi Column)< 1 %
• Columns to JSON< 1 %
• Python Script (1⇒1)< 1 %
• R Snippet< 1 %
• Column to XML< 1 %
• WhichCyp 1.2< 1 %
• Validation and Normalisation (V2)< 1 %
• Sarah Model Maker< 1 %
• 3D RMSD< 1 %
• RDKit MCS< 1 %
• RDKit Molecule Fragmenter< 1 %
• RDKit SDF Difference Checker< 1 %
• ChEMBLdb Connector Input< 1 %
• Compute FlexS Alignments< 1 %
• Compute LeadIT Docking< 1 %
• Search FTrees Fragment Space< 1 %
• Reaction Product Enumerator< 1 %
• Write SDF< 1 %
• DOMPE Fingerprint Calculator< 1 %
• MOE Fingerprints (deprecated)< 1 %
• Gaussian< 1 %
• InChI< 1 %
• MOE Descriptors< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Pharmacophore Search< 1 %
• Scaffold Classification Approach< 1 %
• Sequence Convert< 1 %
• Set Molecule Name< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• SVL Snippet< 1 %
• FieldTemplater< 1 %
• Torch/Forge Molecule Viewer< 1 %
• Reaxys Bioactivities< 1 %
• Atom Replacer< 1 %
• Aromatizer< 1 %
• Reaction Automapper< 1 %
• Reaction Builder< 1 %
• DMPK< 1 %
• Mol2 Writer< 1 %
• SMILES Writer< 1 %
• MMFF94 Library Minimizer< 1 %
• NeuroDeRisk IL Profiler< 1 %
• Standard Properties< 1 %
• Table Merger< 1 %
• MolIcmDock< 1 %
• Amberchamber< 1 %
• Spotfire STDF File Writer< 1 %
• PIBR InChI Generator< 1 %
• PIBR Wash Structure< 1 %
• Molecule Descriptor< 1 %
• Newlead< 1 %
• Maestro Molecular Properties< 1 %
• SD-to-Smiles< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• Hierarchical Clustering Report< 1 %
• LigPrep< 1 %
• MAE-to-SD< 1 %
• Extract Properties< 1 %
• Run Maestro Command< 1 %
• Phase Screening< 1 %
• Protein Preparation Wizard< 1 %
• REOS Filter< 1 %
• Split by Structure< 1 %
• String-to-Type< 1 %
• Tautomerizer< 1 %
• Generate Unique Smiles< 1 %
• Align to Inertial Principal Axes< 1 %
• Speedy SMILES Explicit Double Bond Geometry Splitter< 1 %
• Speedy SMILES Explicit Chirality Filter< 1 %
• Speedy SMILES Clean Charges< 1 %
• Speedy SMILES Strip Double Bond Geometry< 1 %
• IF Switch (Flow Variable Value)< 1 %
• Loop End (Upto 6 ports)< 1 %
• Align To Principal Axes< 1 %
• MMP Molecule Filter (RDKit)< 1 %
• MMP Molecule Filter< 1 %
• Apply Transforms (RDKit) (Experimental)< 1 %
• Memory Use< 1 %
• Bemis-Murcko< 1 %
• Charge< 1 %
• Conformers< 1 %
• ECFP/FCFP< 1 %
• Fragmenter< 1 %
• Fuse Fragments< 1 %
• HLB< 1 %
• JC4XL Writer< 1 %
• JChem Oracle Cartridge< 1 %
• LibraryMCS< 1 %
• Markush Enumeration< 1 %
• MarvinTable< 1 %
• MolFragmenter< 1 %
• Pharmacophore Fingerprint< 1 %
• Polar Surface Area< 1 %
• Reaction Fingerprint< 1 %
• R-group Decomposition< 1 %
• Screen3D< 1 %
• Set MolName And Comment< 1 %
• Shape Descriptor< 1 %
• Similarity Calculator< 1 %
• Stereoisomers< 1 %
• Uni Reactor< 1 %
• MarvinSpace< 1 %
• Cluster Molecules< 1 %
• Cyp Score< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Pharmacophore from molecule< 1 %
• Extract pharmacophore points< 1 %
• CheS-Mapper< 1 %
• Duplicate Remover< 1 %
• Reaction Vector Database Writer< 1 %
• Comparisonofmolecules< 1 %
• RSV Database Writer (Multi-Threaded)< 1 %
• RSV Database Writer< 1 %
• Wildcard Parsing Node 2 - Halogen Builder< 1 %
• Molecule Sanitizer< 1 %
• Starting Material Generator< 1 %
• Desirability Ranking< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Activity Cliffs Viewer< 1 %
• Automated Matched Pairs< 1 %
• String to Reaction< 1 %
• Create Collection Column< 1 %
• Binary Objects to Files< 1 %
• Copy/Move Files (legacy)< 1 %
• Strings to Binary Objects< 1 %
• Variable to Table Column< 1 %
• Extract Variables (Data)< 1 %
• Table Row To Variable Loop Start< 1 %
• Database Writer< 1 %
• Database Looping< 1 %
• X-Partitioner< 1 %
• PNN Predictor< 1 %
• PCA< 1 %
• Concatenate (Optional in)< 1 %
• Bootstrap Sampling< 1 %
• Column Combiner< 1 %
• Number to String< 1 %
• String To Number< 1 %
• String to Number< 1 %
• Table Validator< 1 %
• Reference Column Splitter< 1 %
• Constant Value Column Filter< 1 %
• Number Rounder< 1 %
• Shuffle< 1 %
• Table Transposer< 1 %
• Unpivot< 1 %
• CASE Switch Data (End)< 1 %
• IF Switch< 1 %
• Extract Table Dimension< 1 %
• Parallel Coordinates (legacy)< 1 %
• Scatter Plot (legacy)< 1 %
• SDF Inserter< 1 %
• Fingerprint Bayesian Learner< 1 %
• ColumnTextConverter< 1 %
• DB Insert< 1 %
• DB Writer< 1 %
• Random Item Inserter< 1 %
• k-Medoids< 1 %
• Conditional Box Plot< 1 %
• Table to PDF< 1 %
• MoSS MCSS Molecule Similarity< 1 %
• Excel Writer (XLS)< 1 %
• TIBCO File Writer< 1 %
• Java Edit Variable (simple)< 1 %
• Java IF (Table)< 1 %
• Dictionary Tagger< 1 %
• PPilot Connector< 1 %
• Column Filter (legacy)< 1 %
• ROC Curve (JavaScript)< 1 %
• Table Editor (JavaScript)< 1 %
• Table to JSON< 1 %
• JSON Schema Validator< 1 %
• Gaussian Convolution< 1 %
• Labeling to PNG Images< 1 %
• Feature Inserter< 1 %
• Distance Matrix to Network< 1 %
• Ligand Preparation< 1 %
• Python View< 1 %
• Python Script (1⇒2)< 1 %
• Python Script (2⇒2)< 1 %
• Data to Report (BIRT)< 1 %
• GET Request< 1 %
• XML Writer< 1 %
• Dragon 7.0 Descriptors< 1 %
• VEGA 1.1.1 Models< 1 %
• Dumb Joiner< 1 %
• pKa< 1 %
• PKa< 1 %
• Graph Reducer< 1 %
• Tautomers< 1 %
• Derek Alert Matcher (deprecated)< 1 %
• Tanimoto< 1 %
• Lhasa Type Caster< 1 %
• Lhasa Type Caster< 1 %
• RInchI To Rxn< 1 %
• Transformation Applier< 1 %
• WhichCyp 1.0 (replaced)< 1 %
• 3D D-Moments< 1 %
• Lipinski's Rule-of-Five< 1 %
• 3D WHIM< 1 %
• XLogP< 1 %
• RDKit Aromatizer< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition (deprecated)< 1 %
• Dragon 6.0< 1 %
• ChEBI Retriever< 1 %
• ChEBI Searcher< 1 %