R Snippet

Options

Open external

If checked, R will be opened externally, the KNIME input will be loaded as data frame and the script will be available at the clipboard.

Scipt Editor/Unlink from Template

Gives access to the R script after adaptation by the GUI.

Scipt Editor/Edit Template

Gives access to the RGG script.

Templates/Refresh

Loads again the template file.

Templates/Gallery

Generate a temporary webpage shown in a browser which gives an overview about all available templates.

Templates/Description,Source

Description explains what this snippet does. Source displays the RGG script.

Templates/Use this template

Click to load the GUI (or double-click onto the template)

Chunk size to push incoming data

Number of columns to push as one data chunk to R. The default (-1) leads to data transfer without splitting the data in chunks.

Chunk size to pull result data

Number of rows to push as one data chunk to R. The default (-1) leads to data transfer without splitting the data in chunks.

Input Ports

A data table

Output Ports

The data table that the snippet returns

Best Friends (Incoming)

• R Snippet (8 %) 
• CSV Reader (5 %) 
• Column Filter (5 %) Streamable
• File Reader (4 %) Streamable
• Column Rename (4 %) Streamable
• CSV Writer (3 %) Streamable
• RowID (3 %) Streamable
• Table Creator (3 %) 
• Database Reader (legacy) (2 %) 
• Row Filter (2 %) Streamable
• R Snippet (2 %) 
• Column Resorter (2 %) Streamable
• GroupBy (2 %) 
• Joiner (2 %) 
• Sorter (2 %) 
• Group Loop Start (1 %) 
• Concatenate (1 %) Streamable
• String To Number (1 %) StreamableDeprecated
• Row Sampling (1 %) 
• Transpose (1 %) 
• Rule-based Row Filter (1 %) Streamable
• R Source (Table) (1 %) 
• Spark to Table (< 1 %) 
• Example Data (< 1 %) 
• Table Row to Variable (< 1 %) Deprecated
• Chunk Loop Start (< 1 %) 
• Column List Loop Start (< 1 %) 
• Category To Number (< 1 %) Streamable
• Number To String (< 1 %) Deprecated
• Reference Column Filter (< 1 %) Streamable
• Reference Row Filter (< 1 %) 
• Missing Value (< 1 %) 
• Data Generator (< 1 %) Streamable
• Empty Table Creator (< 1 %) 
• Math Formula (< 1 %) Streamable
• XLS Reader (< 1 %) Deprecated
• Excel Reader (XLS) (< 1 %) StreamableDeprecated
• Star (< 1 %) 
• BinningAnalysis (< 1 %) 
• Normalize Plates (NPI) (< 1 %) 
• Normalize Plates (POC) (< 1 %) 
• Python Snippet (< 1 %) 
• Convert to Table (< 1 %) 
• R Snippet (< 1 %) 
• R Snippet (2:1) (< 1 %) 
• Fix Column Names (< 1 %) 
• Octave Script (< 1 %) 
• MolConverter (< 1 %) Streamable
• Download (< 1 %) 
• URL to File Path (< 1 %) Streamable
• Table Column to Variable (< 1 %) Deprecated
• Table Row To Variable Loop Start (< 1 %) 
• ARFF Reader (< 1 %) 
• Database Connection Table Reader (legacy) (< 1 %) 
• Table Reader (< 1 %) Streamable
• Java Edit Variable (< 1 %) 
• Feature Selection Loop End (< 1 %) 
• Loop End (Column Append) (< 1 %) 
• Loop End (< 1 %) 
• Hierarchical Clustering (< 1 %) 
• Scorer (< 1 %) 
• SVM Predictor (< 1 %) Streamable
• Tree Ensemble Predictor (< 1 %) StreamableDeprecated
• Perl Scripting (< 1 %) 
• Add Empty Rows (< 1 %) 
• Concatenate (Optional in) (< 1 %) StreamableDeprecated
• Cell Splitter (< 1 %) Deprecated
• Column Combiner (< 1 %) Streamable
• Insert Column Header (< 1 %) 
• Column Merger (< 1 %) Streamable
• Column Rename (Regex) (< 1 %) Streamable
• Constant Value Column (< 1 %) Streamable
• Linear Correlation (< 1 %) Deprecated
• Cross Joiner (< 1 %) Streamable
• Domain Calculator (< 1 %) 
• Row Splitter (< 1 %) Streamable
• Normalizer (< 1 %) 
• Partitioning (< 1 %) 
• Round Double (< 1 %) Streamable
• Column Splitter (< 1 %) Streamable
• String Manipulation (< 1 %) Streamable
• String Replacer (< 1 %) Streamable
• Rule Engine (< 1 %) Streamable
• Single sample t-test (< 1 %) 
• Statistics (< 1 %) 
• Column Expressions (< 1 %) Streamable
• Excel Reader (XLS) (< 1 %) StreamableDeprecated
• Java IF (Table) (< 1 %) 
• Bag of Words Creator (< 1 %) Deprecated
• Weka Predictor (3.7) (< 1 %) 
• Column Filter (< 1 %) 
• Value Filter (< 1 %) 
• Integer Input (< 1 %) 
• Image Properties (< 1 %) Streamable
• Python Script (1⇒1) (< 1 %) Deprecated
• Python Source (< 1 %) 
• R to Table (< 1 %) 
• String to Date&Time (< 1 %) Streamable
• Extract Date&Time Fields (< 1 %) Streamable
• Moving Aggregation (< 1 %) 
• Show all 100 recommendations

Best Friends (Outgoing)

• R Snippet (11 %) 
• Joiner (8 %) 
• R Plot (7 %) 
• Open in R (4 %) 
• R Snippet (4 %) 
• R Snippet (2:1) (3 %) 
• Column Filter (3 %) Streamable
• GroupBy (3 %) 
• CSV Writer (2 %) Streamable
• Loop End (2 %) 
• Table to Spark (2 %) 
• String Manipulation (2 %) Streamable
• Rule-based Row Filter (2 %) Streamable
• Interactive Table (local) (2 %) 
• Convert to R (1 %) 
• Recursive Loop Start (2 ports) (1 %) 
• Concatenate (1 %) Streamable
• Constant Value Column (1 %) Streamable
• Row Filter (1 %) Streamable
• Partitioning (1 %) 
• Statistics (1 %) 
• Strings To Document (1 %) StreamableDeprecated
• Hive Loader (< 1 %) 
• Table to Spark (< 1 %) 
• Python Snippet (< 1 %) 
• Python Plot (< 1 %) 
• R Plot (< 1 %) 
• R Snippet (2:1) (< 1 %) 
• Octave Script (< 1 %) 
• MyManipulator (< 1 %) 
• Variable to Table Column (< 1 %) StreamableDeprecated
• Table Row To Variable Loop Start (< 1 %) 
• Database Writer (legacy) (< 1 %) Streamable
• Table Writer (< 1 %) 
• Loop End (Column Append) (< 1 %) 
• Counting Loop Start (< 1 %) 
• Chunk Loop Start (< 1 %) 
• PNN Predictor (< 1 %) Streamable
• PCA Apply (< 1 %) Deprecated
• Number To Category (Apply) (< 1 %) 
• String To Number (< 1 %) StreamableDeprecated
• String To SVG (< 1 %) 
• Column Appender (< 1 %) Streamable
• Lag Column (< 1 %) Streamable
• Column Resorter (< 1 %) Streamable
• One to Many (< 1 %) 
• Linear Correlation (< 1 %) Deprecated
• Cross Joiner (< 1 %) Streamable
• HiLite Row Splitter (< 1 %) 
• Missing Value Column Filter (< 1 %) 
• Nominal Value Row Filter (< 1 %) Streamable
• Normalizer (Apply) (< 1 %) Streamable
• Pivoting (< 1 %) 
• Missing Value (< 1 %) 
• Column Rename (< 1 %) Streamable
• RowID (< 1 %) Streamable
• String Replace (Dictionary) (< 1 %) Streamable
• Transpose (< 1 %) 
• Unpivoting (< 1 %) 
• Value Counter (< 1 %) 
• Rule Engine (< 1 %) Streamable
• Data Explorer (< 1 %) 
• End IF (< 1 %) 
• Send Email (< 1 %) 
• Box Plot (local) (< 1 %) 
• Scatter Plot (local) (< 1 %) 
• Color Manager (< 1 %) 
• Random Boolean Assigner (< 1 %) 
• Numeric Distances (< 1 %) 
• Math Formula (< 1 %) Streamable
• XLS Writer (< 1 %) Deprecated
• Excel Sheet Appender (XLS) (< 1 %) Deprecated
• Excel Writer (XLS) (< 1 %) Deprecated
• Send to Tableau Server (< 1 %) 
• MultilayerPerceptron (3.7) (< 1 %) 
• SimpleCart (3.7) (< 1 %) 
• Distance Matrix to Network (< 1 %) 
• Add Table To R (< 1 %) 
• R View (Table) (< 1 %) 
• Table to R (< 1 %) 
• Table Difference Checker (< 1 %) 
• String to Date&Time (< 1 %) Streamable
• String to Date/Time (legacy) (< 1 %) Streamable
• Show all 83 recommendations

Workflows

• hitIdentification 
• normalization 
• 08_​Regularized_​Logistic_​Regression 
• 08_​Regularized_​Logistic_​Regression 

Installation

To use this node in KNIME, install KNIME R Scripting extension from the following update site:

Developers

You want to see the source code for this node? Click the following button and we’ll use our super-powers to find it for you.