RDKit To Molecule

Input Ports

Table containing RDKit molecules

Output Ports

Table with the molecules' converted string representations

Popular Predecessors

• Molecule Type Cast9 %
• RDKit From Molecule8 %
• SDF Reader4 %
• RDKit Canon SMILES3 %
• Column Filter3 %
• Show all 194 recommendations

Popular Successors

• SDF Writer12 %
• Column Filter4 %
• Joiner2 %
• RDKit Descriptor Calculation2 %
• RDKit From Molecule2 %
• CSV Writer2 %
• Duplicate Row Filter1 %
• Row Filter (deprecated)1 %
• RDKit Fingerprint1 %
• RDKit To Molecule1 %
• Column Resorter1 %
• SDF Extractor1 %
• RDKit Canon SMILES1 %
• GroupBy< 1 %
• Excel Writer< 1 %
• LigPrep< 1 %
• MarvinSpace< 1 %
• Substructure Matcher< 1 %
• OpenBabel< 1 %
• RDKit Molecule Substructure Filter< 1 %
• Wash< 1 %
• InChi< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• Concatenate (Optional in)< 1 %
• 3D Viewer< 1 %
• RDKit SDF Difference Checker< 1 %
• Speedy SMILES Chiral Centre Count< 1 %
• MarvinView< 1 %
• Reference Row Filter< 1 %
• String Manipulation< 1 %
• 3D D-Similarity< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Concatenate< 1 %
• Constant Value Column< 1 %
• Column Splitter< 1 %
• Rule-based Row Splitter< 1 %
• SMARTS Query< 1 %
• RDKit Find Murcko Scaffolds< 1 %
• Flare Docking< 1 %
• TIBCO Spotfire File Writer< 1 %
• Multiport Loop End< 1 %
• MolConverter< 1 %
• Loop End< 1 %
• Table Manipulator< 1 %
• Fingerprints< 1 %
• RDKit Diversity Picker< 1 %
• RDKit Molecule Extractor< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition (deprecated)< 1 %
• CIR< 1 %
• PaDEL-Descriptor< 1 %
• Murcko Scaffold< 1 %
• Principal Moment of Intertia (PMI)-Derived Properties< 1 %
• Table Writer< 1 %
• Column Comparator< 1 %
• String to Number< 1 %
• Joiner< 1 %
• Column Rename< 1 %
• Value Counter< 1 %
• Molecule Type Cast< 1 %
• Math Formula< 1 %
• Java Snippet (simple)< 1 %
• Tile View (JavaScript)< 1 %
• Python Script (legacy)< 1 %
• RDKit Add Hs< 1 %
• RDKit From IUPAC< 1 %
• RDKit Molecule to SVG< 1 %
• RDKit Substructure Filter< 1 %
• Tautomer Generator< 1 %
• Pharmacophore Search< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Chemspace Search< 1 %
• Predictor< 1 %
• Canonical SMILES< 1 %
• Component Separator< 1 %
• Feature Remover< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Maestro Molecular Properties< 1 %
• Molecule-to-MAE< 1 %
• LogD Scalar Descriptor< 1 %
• Strings to Binary Objects< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• Chunk Loop Start< 1 %
• Hierarchical Clustering< 1 %
• Expand Bit Vector< 1 %
• Category to Number< 1 %
• Row Splitter (deprecated)< 1 %
• Missing Value< 1 %
• RowID< 1 %
• Sorter< 1 %
• String Replacer< 1 %
• Renderer to Image< 1 %
• Rule-based Row Filter< 1 %
• SDF Inserter< 1 %
• Mol2 Writer< 1 %
• SDF Reader< 1 %
• Ligands Viewer< 1 %
• Universe Marker< 1 %
• Container Output (Table)< 1 %
• Ligand Preparation< 1 %
• Molecule to CDK< 1 %
• 3D Coordinates< 1 %
• Molecular Properties< 1 %
• Hydrogen Manipulator< 1 %
• RDKit Add Conformers< 1 %
• RDKit Generate Coords< 1 %
• RDKit Calculate Charges< 1 %
• RDKit Chemical Transformation< 1 %
• RDKit Functional Group Filter< 1 %
• RDKit From InChI< 1 %
• RDKit Interactive Table< 1 %
• RDKit Kekulizer< 1 %
• RDKit MCS< 1 %
• RDKit Molecule Catalog Filter< 1 %
• RDKit One Component Reaction< 1 %
• RDKit Optimize Geometry< 1 %
• RDKit To InChI< 1 %
• RDKit Salt Stripper< 1 %
• RDKit Structure Normalizer< 1 %
• RDKit Substructure Counter< 1 %
• RDKit Two Component Reaction< 1 %
• ActMolecule from Molecule< 1 %
• Descriptor< 1 %
• Indigo Fingerprint< 1 %
• REOS Filter< 1 %
• Align to Inertial Principal Axes< 1 %
• Fragments to MMPs< 1 %
• Fingerprinter< 1 %
• Loop End< 1 %
• Column List Loop Start< 1 %
• Table Row to Variable Loop Start< 1 %
• WrappedNode Output< 1 %
• Scatter Plot (JavaScript)< 1 %
• Python Script (2⇒1)< 1 %
• RDKit SMILES Headers< 1 %
• Generate 2D Coordinates< 1 %
• Valence Checker< 1 %
• MolIcmDock< 1 %
• Molecule Writer (from MAE)< 1 %
• Speedy SMILES Enumerate Stereoisomers< 1 %
• Ligands Viewer< 1 %
• SyGMa Metabolites< 1 %
• String to Molecule< 1 %
• Java Snippet< 1 %
• Column Auto Type Cast< 1 %
• Column to Grid< 1 %
• SDF Writer< 1 %
• Parallel Chunk Start< 1 %
• Distance Matrix Calculate< 1 %
• Bar Chart< 1 %
• 2D Coordinates< 1 %
• RDKit Molecule Fragmenter< 1 %
• RDKit Open 3D Alignment< 1 %
• ChEMBLdb Connector Input< 1 %
• File Writer< 1 %
• Compute FTrees Similarity< 1 %
• CATS Descriptor< 1 %
• Filter Duplicates< 1 %
• Fingerprint Clustering< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Canvas Molecular Descriptors< 1 %
• PMI Calculation< 1 %
• Speedy SMILES Possible Stereoisomer Count< 1 %
• MMP Molecule Fragment (RDKit)< 1 %
• DbModelEval< 1 %
• MoleculeTransform< 1 %
• Ligands and Proteins Viewer< 1 %
• 2D/3D Scatterplot< 1 %
• Chemical File Writer< 1 %
• Binary Objects to PNGs< 1 %
• Image Writer (Table Column)< 1 %
• Table Writer< 1 %
• Cell Splitter< 1 %
• Number To String< 1 %
• HiLite Row Splitter< 1 %
• Reference Row Splitter< 1 %
• Rank< 1 %
• Row Sampling< 1 %
• Ungroup< 1 %
• Interactive Table (legacy)< 1 %
• SDF Stripper< 1 %
• Similarity Search< 1 %
• Table to PDF< 1 %
• Table View (JavaScript)< 1 %
• Line Plot (JavaScript)< 1 %
• Python Script (1⇒1)< 1 %
• Structure Converter< 1 %
• WhichCyp 1.2< 1 %
• LIQUID< 1 %
• 3D WHIM< 1 %
• Element Filter< 1 %
• RDKit Aromatizer< 1 %
• RDKit Molecule Highlighting< 1 %
• RDKit Remove Hs< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition< 1 %
• Generate 3D Coordinates< 1 %
• Energy Minimizer< 1 %
• QSAR Descriptors< 1 %
• Scaffold Classification Approach< 1 %
• Write MDB< 1 %
• Forge Align< 1 %
• Atom Replacer< 1 %
• Combinatorial Reaction Enumeration (beta)< 1 %
• Organic Splitter< 1 %
• R-Group Decomposer< 1 %
• MCS Scaffold Finder< 1 %
• Molecule Transformation (beta)< 1 %
• Substructure Matcher (deprecated)< 1 %
• ICon< 1 %
• AutoDock Vina< 1 %
• SDF Writer< 1 %
• SMILES Writer< 1 %
• Standard Properties< 1 %
• Duplicate Remover< 1 %
• MolAPFSuperimpose< 1 %
• MolConvertTo3D< 1 %
• MolStandardize< 1 %
• Frag Similarity Search< 1 %
• AutoQSAR Predict< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• Generate Pairwise Matrix< 1 %
• LigPrep< 1 %
• MAE-to-Mol2< 1 %
• Reaction Based Enumeration< 1 %
• Set Molecule Title< 1 %
• Table Viewer< 1 %
• Speedy SMILES De-salt< 1 %
• Fingerprint to String< 1 %
• MMP Molecule Multi-cut Fragment (RDKit)< 1 %
• Inject Column Properties< 1 %
• Advanced MolConverter< 1 %
• Join Reaction< 1 %
• logP< 1 %
• LogP Scalar Descriptor< 1 %
• MCS< 1 %
• MolSearch< 1 %
• R-group Decomposition< 1 %
• Similarity Calculator< 1 %
• Aqueous Solubility< 1 %
• Structure Checker< 1 %
• Pharmacophore from molecule< 1 %
• Pharmacophore< 1 %
• CheS-Mapper< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Automated Matched Pairs< 1 %
• Plane of Best Fit Calculator< 1 %
• Similarity Viewer< 1 %
• URI to Port< 1 %
• Catch Errors (Data Ports)< 1 %
• Table Row To Variable Loop Start< 1 %
• CSV Writer< 1 %
• Loop End (Column Append)< 1 %
• DBSCAN< 1 %
• PCA< 1 %
• Cell Replacer< 1 %
• Column Combiner< 1 %
• Category to Number (Apply)< 1 %
• Number to Category (Apply)< 1 %
• Column Appender< 1 %
• Column Merger< 1 %
• Reference Column Splitter< 1 %
• Partitioning< 1 %
• Pivot< 1 %
• Number Rounder< 1 %
• Numeric Row Splitter< 1 %
• String Manipulation (Multi Column)< 1 %
• Rule Engine< 1 %
• CASE Switch Data (End)< 1 %
• End IF< 1 %
• Color Manager< 1 %
• ROC Curve (legacy)< 1 %
• Save Workflow< 1 %
• Molfile Writer< 1 %
• Smiles Directory Writer< 1 %
• Parallel Chunk End< 1 %
• DB Writer< 1 %
• Counter Generation< 1 %
• Numeric Distances< 1 %
• MoSS MCSS Molecule Similarity< 1 %
• MoSS< 1 %
• External Tool< 1 %
• Bar Chart (JFreeChart)< 1 %
• Excel Sheet Appender (XLS)< 1 %
• Excel Writer (XLS)< 1 %
• Excel Sheet Appender (XLS)< 1 %
• Excel Writer (XLS)< 1 %
• Java Snippet Row Splitter< 1 %
• Column Selection Configuration< 1 %
• Object Inserter< 1 %
• Python Script (1⇒1)< 1 %
• Python Script (1⇒2)< 1 %
• Data to Report (BIRT)< 1 %
• Date&Time-based Row Filter< 1 %
• Dragon 7.0 Descriptors< 1 %
• JPlogP< 1 %
• Pharmacophore Descriptors< 1 %
• Connectivity< 1 %
• Lipinski's Rule-of-Five< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• Sugar Remover< 1 %
• RDKit Fingerprint Writer< 1 %
• RDKit RMSD Filter< 1 %