RDKit Descriptor Calculation

Input Ports

Table containing RDKit Molecules.

Output Ports

Table containing calculated descriptor values.

Popular Predecessors

• RDKit From Molecule8 %
• Molecule Type Cast7 %
• SDF Reader5 %
• RDKit Canon SMILES3 %
• Joiner2 %
• RDKit Salt Stripper2 %
• Row Filter (deprecated)2 %
• Duplicate Row Filter1 %
• OpenBabel1 %
• Column Filter1 %
• CSV Reader1 %
• Concatenate1 %
• RDKit To Molecule1 %
• RDKit Fingerprint1 %
• String Manipulation< 1 %
• Molecule to CDK< 1 %
• Molecular Properties< 1 %
• RDKit Descriptor Calculation< 1 %
• Missing Value Column Filter< 1 %
• RDKit To InChI< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• RDKit Find Murcko Scaffolds< 1 %
• Rule Engine< 1 %
• Constant Value Column< 1 %
• GroupBy< 1 %
• Joiner< 1 %
• Smiles Directory Reader< 1 %
• RDKit Generate Coords< 1 %
• RDKit Interactive Table< 1 %
• RDKit Molecule Substructure Filter< 1 %
• RowID< 1 %
• Excel Reader (XLS)< 1 %
• CSV Reader< 1 %
• Tile View (JavaScript)< 1 %
• Java Snippet< 1 %
• Nominal Value Row Filter< 1 %
• Row Splitter (deprecated)< 1 %
• Math Formula< 1 %
• Expand Bit Vector< 1 %
• Java Snippet Row Splitter< 1 %
• Column Rename< 1 %
• RDKit Aromatizer< 1 %
• RDKit Structure Normalizer< 1 %
• MAE-to-SD< 1 %
• SDF Writer< 1 %
• Sorter< 1 %
• CDK to Molecule< 1 %
• Fingerprints< 1 %
• RDKit Add Hs< 1 %
• RDKit Molecule Extractor< 1 %
• Reaction Product Enumerator< 1 %
• String to Molecule< 1 %
• RDKit Molecule Fragmenter< 1 %
• RDKit One Component Reaction< 1 %
• Shuffle< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition< 1 %
• Substructure Matcher< 1 %
• MarvinSketch< 1 %
• File Reader< 1 %
• Column Resorter< 1 %
• Partitioning< 1 %
• Missing Value< 1 %
• Rule-based Row Filter< 1 %
• SMILES Reader< 1 %
• logD< 1 %
• Element Filter< 1 %
• RDKit Two Component Reaction< 1 %
• Molecule Converter (Naomi)< 1 %
• Speedy SMILES Remove s-Block Metal-containing Molecules Splitter< 1 %
• Unpivot< 1 %
• Hydrogen Remover< 1 %
• Speedy SMILES Enumerate Stereoisomers< 1 %
• Polar Surface Area< 1 %
• MolConverter< 1 %
• Split Collection Column< 1 %
• Group Loop Start< 1 %
• Row Sampling< 1 %
• Rule-based Row Splitter< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• RDKit Kekulizer< 1 %
• RDKit Substructure Filter< 1 %
• Speedy SMILES Chiral Centre Count< 1 %
• Load SD-Files (SDF)< 1 %
• Pivot< 1 %
• Lipinski's Rule-of-Five< 1 %
• Hydrogen Manipulator< 1 %
• LiveDesign Input< 1 %
• Number to String< 1 %
• Python Script (legacy)< 1 %
• Wash< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Molecule Reader (to MAE)< 1 %
• MAE-to-Smiles< 1 %
• Smiles Reader< 1 %
• Advanced MolConverter< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Table Creator< 1 %
• Loop End< 1 %
• Concatenate (Optional in)< 1 %
• Reference Row Filter< 1 %
• Reference Row Splitter< 1 %
• Column Splitter< 1 %
• Renderer to Image< 1 %
• Color Manager< 1 %
• SDF Extractor< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• RDKit Add Conformers< 1 %
• RDKit Calculate Charges< 1 %
• RDKit Functional Group Filter< 1 %
• RDKit From InChI< 1 %
• RDKit Molecule Catalog Filter< 1 %
• RDKit Optimize Geometry< 1 %
• RDKit Remove Hs< 1 %
• Murcko Scaffold< 1 %
• Maestro Molecular Properties< 1 %
• Speedy SMILES De-salt< 1 %
• Chemical Terms< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• Column List Loop Start< 1 %
• Generic Loop Start< 1 %
• PCA< 1 %
• Column Aggregator< 1 %
• Column Appender< 1 %
• Domain Calculator< 1 %
• Molfile Reader< 1 %
• Parallel Chunk End< 1 %
• Parallel Chunk Start< 1 %
• Similarity Search< 1 %
• Remove Empty Rows< 1 %
• RDKit Diversity Picker< 1 %
• RDKit SMILES Headers< 1 %
• RDKit Substructure Counter< 1 %
• Molecule Filter (Naomi)< 1 %
• String-to-Type< 1 %
• Principal Moment of Intertia (PMI)-Derived Properties< 1 %
• MolImporter< 1 %
• pKa< 1 %
• Standardizer< 1 %
• File Reader< 1 %
• Table Reader< 1 %
• Loop End< 1 %
• Table Manipulator< 1 %
• Excel Reader< 1 %
• File Reader (Complex Format)< 1 %
• Speedy SMILES Strip Stereochemistry< 1 %
• SDF Stripper< 1 %
• String to Number< 1 %
• RDKit Molecule to SVG< 1 %
• Cell Replacer< 1 %
• Java Snippet (simple)< 1 %
• Python Script (1⇒1)< 1 %
• Validation and Normalisation< 1 %
• CIR< 1 %
• Chemical Space Searcher (FTrees)< 1 %
• Neutralizer< 1 %
• SDF Reader< 1 %
• Elemental Analysis< 1 %
• Variable to Table Row< 1 %
• Table Reader< 1 %
• String To Number< 1 %
• XLS Reader< 1 %
• AutoDock Vina< 1 %
• Variable to Table Row< 1 %
• Column Auto Type Cast< 1 %
• String Configuration< 1 %
• Connectivity< 1 %
• XLogP< 1 %
• RDKit From IUPAC< 1 %
• Epik< 1 %
• Line Reader< 1 %
• Column Appender< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• MoleculeTransform< 1 %
• Chemical Structures File Reader< 1 %
• Column Merger< 1 %
• Statistics< 1 %
• Structure Converter< 1 %
• RDKit Fingerprint Reader< 1 %
• Component Separator< 1 %
• Desalter< 1 %
• logP< 1 %
• Chemical File Writer< 1 %
• Table Column to Variable< 1 %
• Create Bit Vector< 1 %
• Column Renamer (Dictionary)< 1 %
• Edit Nominal Domain< 1 %
• Ungroup< 1 %
• Excel Reader (XLS)< 1 %
• Column Selection Configuration< 1 %
• RDKit Count-Based Fingerprint< 1 %
• Table Column to Variable< 1 %
• Table Row to Variable Loop Start< 1 %
• Distance Matrix Pair Extractor< 1 %
• Reference Column Filter< 1 %
• String Manipulation (Variable)< 1 %
• Decision Tree to Ruleset< 1 %
• Refresh Button Widget< 1 %
• Read SDF< 1 %
• CATS Descriptor< 1 %
• Read MDB< 1 %
• Molecule-to-MAE< 1 %
• H Bond Donor/Acceptor< 1 %
• SyGMa Metabolites< 1 %
• Fingerprints Expander< 1 %
• Chunk Loop Start< 1 %
• Recursive Loop End< 1 %
• Number to Category (Apply)< 1 %
• Cross Joiner< 1 %
• CASE Switch Data (End)< 1 %
• Distance Matrix Calculate< 1 %
• Math Formula (Multi Column)< 1 %
• R Snippet< 1 %
• Validation< 1 %
• MLFER Descriptors< 1 %
• 3D Coordinates< 1 %
• RDKit Chemical Transformation< 1 %
• ChEMBLdb Connector Input< 1 %
• Read MOE< 1 %
• Dearomatizer< 1 %
• Feature Remover< 1 %
• Organic Splitter< 1 %
• Reaction Splitter< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Molecule Transformation (beta)< 1 %
• SDF Reader< 1 %
• Keyword Density< 1 %
• Main PubChem< 1 %
• CIx Descriptors< 1 %
• SD-to-Smiles< 1 %
• Canvas Molecular Descriptors< 1 %
• Speedy SMILES Element Count (C, N, O)< 1 %
• Speedy SMILES Heavy Atom Count (HAC)< 1 %
• Speedy SMILES Remove f-block Metal-containing Molecules Splitter< 1 %
• Fingerprint to Binary String< 1 %
• Chunk Loop Run-for-time Loop Start< 1 %
• Load Local Mol2 Files< 1 %
• MMP Molecule Filter (RDKit)< 1 %
• MMP Molecule Fragment (RDKit)< 1 %
• MMP Molecule Multi-cut Fragment (RDKit)< 1 %
• Fingerprint Properties< 1 %
• PDB Loader< 1 %
• Dipole Moment Calculation< 1 %
• Maccs Fingerprint< 1 %
• Split Into Fragments< 1 %
• Desirability Ranking< 1 %
• Automated Matched Pairs< 1 %
• CSV Array Reader< 1 %
• Random Forest Predictor (Regression)< 1 %
• Auto-Binner< 1 %
• Column Comparator< 1 %
• Number To String< 1 %
• Correlation Filter< 1 %
• Double to Integer< 1 %
• Equal Size Sampling< 1 %
• HiLite Row Splitter< 1 %
• Low Variance Filter< 1 %
• Number To String (PMML)< 1 %
• Numeric Row Splitter< 1 %
• Target Shuffling< 1 %
• End IF< 1 %
• Extract Table Spec< 1 %
• Merge Variables< 1 %
• SDF Inserter< 1 %
• Mol2 Reader< 1 %
• DB Reader< 1 %
• Counter Generation< 1 %
• TimeDelay Loop Start< 1 %
• Visual 2D Data Generator< 1 %
• Generic Web Service Client< 1 %
• Excel Reader (XLS)< 1 %
• Column Filter Configuration< 1 %
• Integer Configuration< 1 %
• Multiple Selection Configuration< 1 %
• Table View (JavaScript)< 1 %
• Scatter Plot (JavaScript)< 1 %
• Container Input (Table)< 1 %
• Container Input (JSON)< 1 %
• JSON to Table< 1 %
• Python Script (2⇒1)< 1 %
• String to Date&Time< 1 %
• Molecule File Reader< 1 %
• pKa< 1 %
• 3D D-Similarity< 1 %
• 3D WHIM< 1 %
• Bio Sequence Reader< 1 %
• RDKit Molecule Highlighting< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition (deprecated)< 1 %
• Tautomer Generator< 1 %
• ActMolecule to Molecule< 1 %
• List to FlowVariable< 1 %
• Hydrogen Adder< 1 %
• Fingerprint Similarity Calculator< 1 %
• PDB Reader< 1 %
• QikProp< 1 %
• Speedy SMILES Remove Broken Bonds Splitter< 1 %
• Speedy SMILES Remove d-block Metal-containing Molecules Splitter< 1 %
• Speedy SMILES Clean Charges< 1 %
• Speedy SMILES Replace Dummy Atom< 1 %
• MMP Show Matching Bonds (RDKit)< 1 %
• Reference Fragments to MMPs< 1 %
• Geometrical Descriptors< 1 %
• Major Microspecies< 1 %
• Aqueous Solubility< 1 %
• Topology Analysis< 1 %
• Wait...< 1 %
• Loop End (Column Append)< 1 %
• DBSCAN< 1 %
• Numeric Scorer< 1 %
• Cell Splitter< 1 %
• Linear Correlation< 1 %
• String Replacer< 1 %
• Cache< 1 %
• Variable Expressions< 1 %
• Range Slider Filter Definition (legacy)< 1 %
• Interactive Range Slider Filter Widget< 1 %
• Multiple Selection Widget< 1 %
• Call Workflow (Table Based)< 1 %
• GET Request< 1 %
• SMARTCyp 2.4.2< 1 %
• 2D Coordinates< 1 %
• Sugar Remover< 1 %
• RDKit Adjust Query Properties< 1 %

Popular Successors

• Row Filter (deprecated)6 %
• Column Filter5 %
• Math Formula3 %
• Row Splitter (deprecated)2 %
• SDF Writer2 %
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