RDKit Canon SMILES

Input Ports

Data with RDKit Mol column

Output Ports

Data with canonical SMILES column

Popular Predecessors

• Molecule Type Cast10 %
• RDKit From Molecule7 %
• SDF Reader6 %
• Column Filter3 %
• RDKit Salt Stripper2 %
• Excel Reader (XLS)2 %
• Concatenate (Optional in)2 %
• CSV Reader1 %
• Excel Reader1 %
• Row Filter (deprecated)1 %
• Sorter1 %
• Concatenate1 %
• RDKit Structure Normalizer1 %
• MolConverter1 %
• Standardizer1 %
• Column Rename< 1 %
• RDKit From InChI< 1 %
• RDKit Molecule Extractor< 1 %
• RDKit Functional Group Filter< 1 %
• RDKit One Component Reaction< 1 %
• RDKit Chemical Transformation< 1 %
• Advanced MolConverter< 1 %
• Table Creator< 1 %
• RDKit Canon SMILES< 1 %
• RDKit Find Murcko Scaffolds< 1 %
• MAE-to-Smiles< 1 %
• RDKit Two Component Reaction< 1 %
• Read MDB< 1 %
• RDKit To Molecule< 1 %
• Column Resorter< 1 %
• Row Splitter (deprecated)< 1 %
• RDKit Descriptor Calculation< 1 %
• RDKit Kekulizer< 1 %
• Duplicate Row Filter< 1 %
• RDKit From IUPAC< 1 %
• Column to Grid< 1 %
• OpenBabel< 1 %
• RDKit Diversity Picker< 1 %
• Reference Row Splitter< 1 %
• RDKit Add Hs< 1 %
• File Reader (Complex Format)< 1 %
• Joiner< 1 %
• Table Reader< 1 %
• SDF Extractor< 1 %
• RDKit Aromatizer< 1 %
• RDKit Interactive Table< 1 %
• Chemical Space Enumerator< 1 %
• Speedy SMILES Strip Double Bond Geometry< 1 %
• Shuffle< 1 %
• RDKit Substructure Counter< 1 %
• Speedy SMILES Clean Isotope Labels< 1 %
• Smiles Reader< 1 %
• Chunk Loop Start< 1 %
• Mol2 Reader< 1 %
• Parallel Chunk Start< 1 %
• Column Rename (Regex)< 1 %
• String Replacer< 1 %
• SDF Stripper< 1 %
• Renderer to Image< 1 %
• Column Aggregator< 1 %
• Recursive Loop End< 1 %
• Column Renamer< 1 %
• Wash< 1 %
• MAE-to-SD< 1 %
• MarvinSketch< 1 %
• CSV Reader< 1 %
• File Reader< 1 %
• Constant Value Column< 1 %
• Missing Value< 1 %
• Column Splitter< 1 %
• Smiles Directory Reader< 1 %
• Math Formula< 1 %
• Molecular Properties< 1 %
• RDKit SMILES Headers< 1 %
• Tautomer Generator< 1 %
• Reaction Builder< 1 %
• SD-to-Smiles< 1 %
• Speedy SMILES Heavy Atom Count (HAC)< 1 %
• Speedy SMILES Strip Stereochemistry< 1 %
• Rule-based Row Splitter< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition< 1 %
• Molecule Reader (to MAE)< 1 %
• File Reader< 1 %
• Table Manipulator< 1 %
• RDKit Structure Normalizer< 1 %
• Convert Molecules with Naomi< 1 %
• Canonical SMILES< 1 %
• Standardizer< 1 %
• Load SD-Files (SDF)< 1 %
• Elemental Analysis< 1 %
• Java Snippet< 1 %
• Loop End (Column Append)< 1 %
• Loop End< 1 %
• Reference Row Filter< 1 %
• GroupBy< 1 %
• Joiner< 1 %
• Partitioning< 1 %
• RowID< 1 %
• String Manipulation< 1 %
• Ungroup< 1 %
• Rule-based Row Filter< 1 %
• Rule Engine< 1 %
• XLS Reader< 1 %
• CDK to Molecule< 1 %
• Molecule to CDK< 1 %
• RDKit Generate Coords< 1 %
• RDKit Molecule Catalog Filter< 1 %
• RDKit Optimize Geometry< 1 %
• RDKit Fingerprint< 1 %
• RDKit To InChI< 1 %
• RDKit Remove Hs< 1 %
• RDKit R-Group Decomposition (deprecated)< 1 %
• RDKit Substructure Filter< 1 %
• CIR< 1 %
• Dearomatizer< 1 %
• Feature Remover< 1 %
• Murcko Scaffold< 1 %
• Molecule Transformation (beta)< 1 %
• Speedy SMILES De-salt< 1 %
• String to Number< 1 %
• Excel Reader (XLS)< 1 %
• 2D Coordinates< 1 %
• Element Filter< 1 %
• Structure Sketcher< 1 %
• RDKit Molecule Substructure Filter< 1 %
• LigPrep< 1 %
• String-to-Type< 1 %
• Table Reader< 1 %
• Loop End< 1 %
• Column Appender< 1 %
• Correlation Filter< 1 %
• Pivot< 1 %
• Column Expressions< 1 %
• Stereoisomers< 1 %
• Variable to Table Row< 1 %
• DART / CDF Exporter< 1 %
• Extract Properties< 1 %
• Python Script< 1 %
• Chemical Sketcher< 1 %
• RDKit MCS< 1 %
• ChEBI Searcher< 1 %
• File Reader< 1 %
• Chemical Structures File Reader< 1 %
• Group Loop Start< 1 %
• Table Transposer< 1 %
• Cache< 1 %
• k-Medoids< 1 %
• Excel Reader (XLS)< 1 %
• RDKit Add Conformers< 1 %
• Variable to Table Column< 1 %
• Cell Splitter By Position< 1 %
• Value Selection Configuration< 1 %
• Parallel Chunk End< 1 %
• CIR< 1 %
• ActMolecule from Molecule< 1 %
• MMP Molecule Fragment (RDKit)< 1 %
• BARD Search by Structure< 1 %
• MolImporter< 1 %
• Column Merger< 1 %
• Numeric Row Splitter< 1 %
• End IF< 1 %
• Substructure Search< 1 %
• RDKit Molecule Highlighting< 1 %
• Duplicate Filter< 1 %
• Normalizer< 1 %
• Hydrogen Adder< 1 %
• Recursive Loop End< 1 %
• Number To String< 1 %
• Row Sampling< 1 %
• Java Snippet (simple)< 1 %
• JSON Path< 1 %
• SMARTS Query< 1 %
• RDKit Molecule Fragmenter< 1 %
• ActMolecule from IDCode< 1 %
• Hydrogen Remover< 1 %
• R-Group Decomposer< 1 %
• Reaction Splitter< 1 %
• Speedy SMILES Ring Count< 1 %
• BARD Compounds< 1 %
• String to Molecule< 1 %
• Split Collection Column< 1 %
• Variable to Table Row< 1 %
• Column List Loop Start< 1 %
• Variable Condition Loop End< 1 %
• Column Appender< 1 %
• Value Counter< 1 %
• Numeric Outliers< 1 %
• Save Workflow< 1 %
• Hydrogen Manipulator< 1 %
• Mass Calculator< 1 %
• Speedy SMILES Clean '.' non-bonds< 1 %
• Speedy SMILES Enumerate Stereoisomers< 1 %
• CASE Switch End< 1 %
• List Box Input (legacy)< 1 %
• Remove Empty Rows< 1 %
• Wash< 1 %
• Stereo Enumeration< 1 %
• LDB Reader< 1 %
• Clustered MCS< 1 %
• Fragments to MMPs< 1 %
• MMP Molecule Fragment (3rd Gen)< 1 %
• Table Row To Variable Loop Start< 1 %
• Database Reader< 1 %
• String To Number< 1 %
• HiLite Row Splitter< 1 %
• MoSS< 1 %
• R Snippet< 1 %
• ChEMBLdb Connector< 1 %
• ActMolecule to Molecule< 1 %
• CDD Export< 1 %
• Pharmacophore Search< 1 %
• SMILES Input< 1 %
• InChi< 1 %
• Molecule Properties< 1 %
• Organic Splitter< 1 %
• Substructure Matcher< 1 %
• Valence Checker< 1 %
• Chiralator< 1 %
• Import from LiveDesign< 1 %
• Set Molecule Title< 1 %
• Generate Unique Smiles< 1 %
• PMI Calculation< 1 %
• Speedy SMILES Clean Bonds< 1 %
• Speedy SMILES Clean Charges< 1 %
• Speedy SMILES Dummy Atom Isotope to Atom Class Label< 1 %
• Speedy SMILES Replace Dummy Atom< 1 %
• Table Row To Variable Run-for-time Loop Start< 1 %
• Load Local Mol2 Files< 1 %
• Load Local PDB Files< 1 %
• Benchmark End< 1 %
• Benchmark Start< 1 %
• PDB SMILES Query< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Automated Matched Pairs< 1 %
• Pareto Ranking< 1 %
• Create Collection Column< 1 %
• Loop End (2 ports)< 1 %
• Decision Tree Predictor< 1 %
• Cell Splitter< 1 %
• Column Auto Type Cast< 1 %
• Category to Number< 1 %
• Number to String< 1 %
• Cross Joiner< 1 %
• Constant Value Column Filter< 1 %
• Missing Value Column Filter< 1 %
• Low Variance Filter< 1 %
• String Splitter (Regex)< 1 %
• Number Rounder< 1 %
• String Manipulation (Variable)< 1 %
• String Replace (Dictionary)< 1 %
• Empty Table Switch< 1 %
• CASE Switch Data (End)< 1 %
• CASE Switch Data (Start)< 1 %
• Merge Variables< 1 %
• SDF Inserter< 1 %
• Molfile Reader< 1 %
• Fingerprint Bayesian Predictor< 1 %
• Counter Generation< 1 %
• Table View (JavaScript)< 1 %
• Column Selection Widget< 1 %
• XPath< 1 %
• Connectivity< 1 %
• 3D Coordinates< 1 %
• Lipinski's Rule-of-Five< 1 %
• Fingerprints< 1 %
• Fingerprint Similarity< 1 %
• Symmetry< 1 %
• RDKit Adjust Query Properties< 1 %
• RDKit Fingerprint Reader< 1 %
• ChEBI Retriever< 1 %
• SDF Reader< 1 %
• CIx Translation< 1 %
• DART / CDF Exporter< 1 %
• Neutralizer< 1 %
• Speedy SMILES Element Count (C, N, O)< 1 %
• Speedy SMILES Remove s-Block Metal-containing Molecules Filter< 1 %
• Load Local Mol Files< 1 %
• List To Set< 1 %
• Set To List< 1 %
• Multiple MolImporter< 1 %
• pKa< 1 %
• Structure Checker< 1 %
• Tautomers< 1 %
• Catch Errors (Data Ports)< 1 %
• Table Row to Variable< 1 %
• Cell Splitter< 1 %
• Column Comparator< 1 %
• Nominal Value Row Filter< 1 %
• Nominal Value Row Splitter< 1 %
• Column Filter (legacy)< 1 %
• Python Script (legacy)< 1 %
• Rxn to RInChI< 1 %
• XLogP< 1 %
• RDKit Molecule to SVG< 1 %

Popular Successors

• Duplicate Row Filter6 %
• Column Filter5 %
• RDKit Descriptor Calculation3 %
• CSV Writer3 %
• Row Filter (deprecated)2 %
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