Fuzzy c-Means

Options

Number of clusters

Number of clusters to use for the algorithm.

Maximum number of iterations

This is the maximum number of iterations to be performed.

Fuzzifier

Indicates how much the clusters are allowed to overlap.

Use seed for random initialization

If this checkbox is set, a seed can be set for initializing the cluster prototypes.

Induce noise cluster

Whether to induce a noise cluster or not.

Set delta

Delta is the fixed distance from every datapoint to the noise cluster.

Set delta automatically, specify lambda

Delta is updated in each iteration, based on the average interpoint distances. However, a lambda paramater has to be set, according to the shape of the clusters.

Perform the clustering in memory

If this option is selected, the clustering is performed in the memory, which speeds up the process.

Compute cluster quality measures

Whether to calculate quality measures for the clustering. This can be time and memory consuming with large datasets.

Input Ports

Datatable with training data. Make sure that the data are normalized!

Output Ports

Input table extended by cluster membership

Cluster centers

Views

Statistics View

Shows the WithinClusterVariation and the BetweenClusterVariation, which are indicators for 'good' clustering.

Best Friends (Incoming)

• Normalizer (8 %) 
• File Reader (7 %) Streamable
• Excel Reader (XLS) (5 %) StreamableDeprecated
• Column Filter (5 %) Streamable
• Missing Value (5 %) 
• CSV Reader (4 %) 
• Row Filter (4 %) Streamable
• One to Many (3 %) 
• GroupBy (2 %) 
• Partitioning (2 %) 
• Color Manager (2 %) 
• k-Means (2 %) 
• String To Number (2 %) StreamableDeprecated
• Math Formula (2 %) Streamable
• ARFF Reader (1 %) 
• PCA (1 %) Deprecated
• Number To String (1 %) Deprecated
• Joiner (1 %) 
• Scatter Plot (local) (1 %) 
• XLS Reader (1 %) Deprecated
• Excel Reader (XLS) (1 %) StreamableDeprecated
• Split Collection Column (< 1 %) 
• Table Row To Variable Loop Start (< 1 %) 
• Database Reader (legacy) (< 1 %) 
• Fuzzy c-Means (< 1 %) 
• DBSCAN (< 1 %) 
• Scorer (< 1 %) 
• Association Rule Learner (< 1 %) 
• Category To Number (< 1 %) Streamable
• Correlation Filter (< 1 %) 
• Domain Calculator (< 1 %) 
• Reference Column Filter (< 1 %) Streamable
• Row Splitter (< 1 %) Streamable
• Normalizer (PMML) (< 1 %) 
• Column Rename (< 1 %) Streamable
• Row Sampling (< 1 %) 
• Column Splitter (< 1 %) Streamable
• Rule-based Row Filter (< 1 %) Streamable
• Rank Correlation (< 1 %) Deprecated
• Statistics (< 1 %) 
• Parameter Optimization Loop Start (< 1 %) 
• Outlier Removal (< 1 %) 
• Database Connection Table Reader (legacy) (< 1 %) 
• Table Reader (< 1 %) Streamable
• Table Creator (< 1 %) 
• Java Snippet (< 1 %) Streamable
• Loop End (2 ports) (< 1 %) 
• Counting Loop Start (< 1 %) 
• Chunk Loop Start (< 1 %) 
• Generic Loop Start (< 1 %) 
• Fuzzy Rule Learner (< 1 %) 
• Cluster Assigner (< 1 %) Streamable
• Hierarchical Clustering (< 1 %) 
• Hierarchical Cluster Assigner (< 1 %) 
• K Nearest Neighbor (< 1 %) StreamableDeprecated
• PCA Apply (< 1 %) Deprecated
• Add Empty Rows (< 1 %) 
• Concatenate (Optional in) (< 1 %) StreamableDeprecated
• Auto-Binner (< 1 %) 
• Numeric Binner (< 1 %) Streamable
• Create Bit Vector (< 1 %) 
• Cell Splitter (< 1 %) Deprecated
• Column Appender (< 1 %) Streamable
• Column Rename (Regex) (< 1 %) Streamable
• Linear Correlation (< 1 %) Deprecated
• Double To Int (< 1 %) Streamable
• Missing Value Column Filter (< 1 %) 
• Reference Row Filter (< 1 %) 
• Low Variance Filter (< 1 %) 
• Pivoting (< 1 %) 
• Normalizer Apply (PMML) (< 1 %) Streamable
• String Manipulation (< 1 %) Streamable
• Transpose (< 1 %) 
• Rule Engine (< 1 %) Streamable
• Rule-based Row Splitter (< 1 %) Streamable
• Data Generator (< 1 %) Streamable
• Timer Info (< 1 %) 
• Spark Entropy Scorer (< 1 %) 
• Distance Matrix Calculate (< 1 %) 
• Similarity Search (< 1 %) 
• H2O to Table (< 1 %) 
• Read XLS Sheet Names (< 1 %) Deprecated
• Java Snippet (simple) (< 1 %) 
• Java Edit Variable (simple) (< 1 %) 
• TF (< 1 %) 
• Keygraph Keyword Extractor (< 1 %) 
• String Matcher (< 1 %) 
• Bag of Words Creator (< 1 %) Deprecated
• Document Data Extractor (< 1 %) 
• Document vector (< 1 %) Deprecated
• Term Vector (< 1 %) 
• JPMML Classifier (< 1 %) 
• Image Reader (< 1 %) Streamable
• Python Script (1⇒1) (< 1 %) Deprecated
• R Snippet (< 1 %) 
• String to Date&Time (< 1 %) Streamable
• Time Difference (legacy) (< 1 %) 
• Moving Aggregation (< 1 %) 
• RDKit MCS (< 1 %) 
• RDKit Fingerprint (< 1 %) Streamable
• Show all 100 recommendations

Best Friends (Outgoing)

• Color Manager (10 %) 
• Cluster Assigner (8 %) Streamable
• Joiner (5 %) 
• GroupBy (4 %) 
• Scatter Plot (local) (4 %) 
• Entropy Scorer (3 %) 
• Column Filter (3 %) Streamable
• Row Filter (3 %) Streamable
• Denormalizer (2 %) Streamable
• Column Rename (2 %) Streamable
• Interactive Table (local) (2 %) 
• Scorer (2 %) 
• Value Counter (2 %) 
• Excel Writer (XLS) (2 %) Deprecated
• CSV Writer (2 %) Streamable
• Random Forest Learner (2 %) 
• SOTA Predictor (1 %) 
• Denormalizer (PMML) (1 %) Streamable
• Sorter (1 %) 
• Decision Tree View (1 %) 
• Scatter Plot (1 %) 
• Hierarchical Clustering (< 1 %) 
• Decision Tree Learner (< 1 %) 
• Row Splitter (< 1 %) Streamable
• Partitioning (< 1 %) 
• Rule Engine (< 1 %) Streamable
• Shape Manager (< 1 %) 
• HeatMap (JFreeChart) (< 1 %) 
• Java Snippet (< 1 %) Streamable
• Fuzzy Rule Learner (< 1 %) 
• Fuzzy c-Means (< 1 %) 
• Hierarchical Cluster View (< 1 %) 
• k-Means (< 1 %) 
• SOTA Learner (< 1 %) 
• Linear Correlation (< 1 %) Deprecated
• Pivoting (< 1 %) 
• Statistics (< 1 %) 
• Conditional Box Plot (local) (< 1 %) 
• K Nearest Neighbor (Distance Function) (< 1 %) Deprecated
• Scatter Plot (JFreeChart) (< 1 %) 
• XLS Writer (< 1 %) Deprecated
• Diverse Subset (< 1 %) 
• Data to Report (< 1 %) 
• Bubble-set Chart (< 1 %) 
• 2D/3D Scatterplot (< 1 %) 
• Entropy Uncertainty Scorer (< 1 %) Streamable
• Variable to Table Column (< 1 %) StreamableDeprecated
• Model Writer (< 1 %) 
• Loop End (2 ports) (< 1 %) 
• Loop End (Column Append) (< 1 %) 
• Loop End (< 1 %) 
• X-Partitioner (< 1 %) 
• Naive Bayes Learner (< 1 %) Deprecated
• Naive Bayes Predictor (< 1 %) StreamableDeprecated
• Fuzzy Rule Predictor (< 1 %) Streamable
• K Nearest Neighbor (< 1 %) StreamableDeprecated
• MultiLayerPerceptron Predictor (< 1 %) Streamable
• PCA (< 1 %) Deprecated
• Linear Regression Learner (< 1 %) 
• Numeric Scorer (< 1 %) Deprecated
• Gradient Boosted Trees Learner (< 1 %) Deprecated
• Random Forest Learner (< 1 %) Deprecated
• PMML Model Appender (< 1 %) 
• Auto-Binner (< 1 %) 
• Cell Replacer (< 1 %) Streamable
• Column Combiner (< 1 %) Streamable
• Category To Number (< 1 %) Streamable
• Number To Category (Apply) (< 1 %) 
• Number To String (< 1 %) Deprecated
• String To Number (< 1 %) StreamableDeprecated
• Column Appender (< 1 %) Streamable
• One to Many (< 1 %) 
• Correlation Filter (< 1 %) 
• Cross Joiner (< 1 %) Streamable
• HiLite Row Splitter (< 1 %) 
• Nominal Value Row Filter (< 1 %) Streamable
• Normalizer (< 1 %) 
• Missing Value (< 1 %) 
• RowID (< 1 %) Streamable
• Column Splitter (< 1 %) Streamable
• String Replacer (< 1 %) Streamable
• Rule-based Row Filter (< 1 %) Streamable
• Rule-based Row Splitter (< 1 %) Streamable
• Cronbach Alpha (< 1 %) 
• Kruskal-Wallis Test (< 1 %) 
• CASE Switch Data (End) (< 1 %) 
• Crosstab (local) (< 1 %) 
• Enrichment Plotter (local) (< 1 %) 
• HiLite Table (local) (< 1 %) 
• Histogram (local) (< 1 %) 
• Interactive Histogram (local) (< 1 %) 
• Lift Chart (local) (< 1 %) 
• Pie chart (local) (< 1 %) 
• Interactive Pie chart (local) (< 1 %) 
• Line Plot (local) (< 1 %) 
• Parallel Coordinates (local) (< 1 %) 
• Scatter Matrix (local) (< 1 %) 
• Color Appender (< 1 %) 
• ROC Curve (local) (< 1 %) 
• PMML to SQL (< 1 %) 
• Distance Matrix Calculate (< 1 %) 
• k-Medoids (< 1 %) 
• Similarity Search (< 1 %) 
• Parallel Coordinates Plot (JavaScript) (< 1 %) 
• Pie/Donut Chart (JavaScript) (< 1 %) 
• PMML Ensemble Predictor (< 1 %) Deprecated
• PMML Ensemble to Table (< 1 %) 
• PMML Predictor (< 1 %) Deprecated
• Math Formula (< 1 %) Streamable
• Math Formula (Multi Column) (< 1 %) Streamable
• Bar Chart (JFreeChart) (< 1 %) 
• LIBSVMPredictor (< 1 %) 
• Rule Viewer (local) (< 1 %) 
• Excel Sheet Appender (XLS) (< 1 %) Deprecated
• Radar Plot Appender (< 1 %) 
• Apriori (3.7) (< 1 %) 
• JPMML Classifier (< 1 %) 
• JPMML Regression Predictor (< 1 %) 
• Column Selection (< 1 %) 
• Scatter Plot (< 1 %) 
• R Snippet (< 1 %) 
• Show all 121 recommendations

Workflows

• Extract Fuzzy Clusters 

Installation

To use this node in KNIME, install KNIME Core from the following update site:

A zipped version of the software site can be downloaded here. Read our FAQs to get instructions about how to install nodes from a zipped update site.

Developers

You want to see the source code for this node? Click the following button and we’ll use our super-powers to find it for you.