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COX1.2

COX-2

COX-1

Cross Validation - Modelo con Fingerprints

Cross Validation - Modelo con Descriptores Moleculares

Cross Validation - Modelo con Descriptores Moleculares y Fingerprints

SIMPLE - Modelo con Fingerprints

Cross Validation - Modelo con Descriptores Moleculares y Fingerprints

Cross Validation - Modelo con Fingerprints

Cross Validation - Modelo con Descriptores Moleculares

SIMPLE - Modelo con Fingerprints

Random Forest Learner (Regression)
X-Partitioner
Solicita a ChemBL el IC50 de 1000 compuestos para COX-1
GET Request
Random Forest Predictor (Regression)
Cambia los nombres sucios del JSON a términos biológicos legibles antes de realizar cualquier otra operación para evitar errores de referencia.
Column Renamer
Elimina de forma definitiva todas las columnas residuales de la consulta HTTP original (body, Status, Content type, RowID).
Column Filter
Extrae las listas del JSON y define directamente sus tipos de variables originales.
JSON Path
Aplana las listas obtenidas y genera las filas individuales conservando los tipos String y Double definidos en el paso anterior.
Ungroup
X-Aggregator
Modifica los metadatos de una columna de texto común (String / S) para etiquetarla oficialmente en KNIME como una columna estructural de tipo quimioinformático (SMILES).
Molecule Type Cast
Numeric Scorer
Convierte todos los SMILES en moléculas
RDKit From Molecule
Filtra todas los casos con datos faltantes, tanto SMILES como IC50
Row Filter
X-Partitioner
X-Partitioner
Random Forest Learner (Regression)
Random Forest Predictor (Regression)
Toma todas las moleculas y les quita las sales
RDKit Salt Stripper
Numeric Scorer
X-Aggregator
Numeric Scorer
Numeric Scorer
Permite pasar Fingerprint a columnas
Expand Bit Vector
Random Forest Learner (Regression)
Random Forest Learner (Regression)
Column Filter
Random Forest Predictor (Regression)
Numeric Scorer
CSV Reader
Random Forest Learner (Regression)
X-Partitioner
Random Forest Predictor (Regression)
X-Aggregator
Random Forest Predictor (Regression)
X-Aggregator
Random Forest Predictor (Regression)
X-Partitioner
Solicita a ChemBL el IC50 de 1000 compuestos para COX-1
GET Request
Extrae las listas del JSON y define directamente sus tipos de variables originales.
JSON Path
Aplana las listas obtenidas y genera las filas individuales conservando los tipos String y Double definidos en el paso anterior.
Ungroup
Cambia los nombres sucios del JSON a términos biológicos legibles antes de realizar cualquier otra operación para evitar errores de referencia.
Column Renamer
Elimina de forma definitiva todas las columnas residuales de la consulta HTTP original (body, Status, Content type, RowID).
Column Filter
Filtra todas los casos con datos faltantes, tanto SMILES como IC50
Row Filter
Modifica los metadatos de una columna de texto común (String / S) para etiquetarla oficialmente en KNIME como una columna estructural de tipo quimioinformático (SMILES).
Molecule Type Cast
Genera 119 Descriptores moleculares desde los SMILES
RDKit Descriptor Calculation
Genera Fingerprints de 1024 bit a partir de SMILES
RDKit Fingerprint
Column Filter
Molecule Type Cast
Random Forest Predictor (Regression)
Column Filter
Convierte el valor de IC50 a pIC50 normalizado a Molaridad
Math Formula
Column Filter
Numeric Scorer
Random Forest Predictor (Regression)
Random Forest Learner (Regression)
Random Forest Predictor (Regression)
Numeric Scorer
COX-1
Model Reader
Genera 119 Descriptores moleculares desde los SMILES
RDKit Descriptor Calculation
X-Aggregator
COX-1
Column Renamer
Column Filter
COX-2
Column Renamer
COX-2
Model Reader
Random Forest Learner (Regression)
Genera Fingerprints de 1024 bit a partir de SMILES
RDKit Fingerprint
Joiner
Random Forest Predictor (Regression)
Variable Filter
Variable Filter
Table Partitioner
Column Filter
Toma la lista de moleculas sin sales y las convierte a SMILES
RDKit Canon SMILES
Random Forest Learner (Regression)
Model Writer
X-Partitioner
Math Formula
X-Aggregator
Joiner
Convierte todos los SMILES en moléculas
RDKit From Molecule
Column Filter
Toma la lista de moleculas sin sales y las convierte a SMILES
RDKit Canon SMILES
Toma todas las moleculas y les quita las sales
RDKit Salt Stripper
Genera 119 Descriptores moleculares desde los SMILES
RDKit Descriptor Calculation
Permite pasar Fingerprint a columnas
Expand Bit Vector
Agrupar SMILES identicos y promediar sus IC50
GroupBy
Column Filter
Model Writer
Convierte el valor de IC50 a pIC50 normalizado a Molaridad
Math Formula
Numeric Scorer
Table Partitioner
Genera Fingerprints de 1024 bit a partir de SMILES
RDKit Fingerprint
Agrupar SMILES identicos y promediar sus IC50
GroupBy

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