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01_R-Group_Decomposition

This workflow demonstrates how to perform R-Group Decomposition using the RDKit community extension.
The workflow has several steps
I. Compute MCS.
II. Perform R-Group Decomposition.
III. Find how many molecules with each combination of the two selected R-groups are in the dataset.
IV. Visualize the results of the R-group decomposition.

SVGの可視化 HMLタグで可視化 PNGの可視化　画像表示できないelement edit入力データ91個の構造式が含まれている91個の化学構造式から80%共通している最大の骨格（母骨格）を抽出母骨格をRDkit分子に変換化学構造式を分解core:母骨格化学構造式をレンダリング母骨格を変数として次ノードに渡すRグループの画像を埋め込む列名の変更Rグループ分子レンダリングelement edit化学構造式をレンダリングelement edit GenericJavaScript View Pivoting Table Reader RDKit MCS RDKit From Molecule RDKit R-GroupDecomposition Renderer to Image Table Rowto Variable Embed images forthe R-groups Render to images Pick R-groups forvisualization GenericJavaScript View Renderer to Image GenericJavaScript View SVGの可視化 HMLタグで可視化 PNGの可視化　画像表示できないelement edit入力データ91個の構造式が含まれている91個の化学構造式から80%共通している最大の骨格（母骨格）を抽出母骨格をRDkit分子に変換化学構造式を分解core:母骨格化学構造式をレンダリング母骨格を変数として次ノードに渡すRグループの画像を埋め込む列名の変更Rグループ分子レンダリングelement edit化学構造式をレンダリングelement editGenericJavaScript View Pivoting Table Reader RDKit MCS RDKit From Molecule RDKit R-GroupDecomposition Renderer to Image Table Rowto Variable Embed images forthe R-groups Render to images Pick R-groups forvisualization GenericJavaScript View Renderer to Image GenericJavaScript View

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Created by: daria_knime
Created at: 2020-04-16
On NodePit since: 2022-02-06
Last update: 2024-04-28
Created with KNIME version: v4.1.3
Tags: rdkitcheminformaticsr-group

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